Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms