Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms