Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COMMD8Q9NX08 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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