Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX07

TRNAU1AP, tRNA selenocysteine 1-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNAU1APQ9NX07 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRNAU1APQ9NX07 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms