Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 LINC01922-201ENST00000562582 719 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms