Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG4

SMYD2, N-lysine methyltransferase SMYD2, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD2Q9NRG4 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms