Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
DUOX2Q9NRD8 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms