Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS5

EPB41L4A, Band 4.1-like protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L4AQ9HCS5 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
EPB41L4AQ9HCS5 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPB41L4AQ9HCS5 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPB41L4AQ9HCS5 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPB41L4AQ9HCS5 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPB41L4AQ9HCS5 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPB41L4AQ9HCS5 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPB41L4AQ9HCS5 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPB41L4AQ9HCS5 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPB41L4AQ9HCS5 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPB41L4AQ9HCS5 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPB41L4AQ9HCS5 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPB41L4AQ9HCS5 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPB41L4AQ9HCS5 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPB41L4AQ9HCS5 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPB41L4AQ9HCS5 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPB41L4AQ9HCS5 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPB41L4AQ9HCS5 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPB41L4AQ9HCS5 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPB41L4AQ9HCS5 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPB41L4AQ9HCS5 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPB41L4AQ9HCS5 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPB41L4AQ9HCS5 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
EPB41L4AQ9HCS5 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPB41L4AQ9HCS5 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
EPB41L4AQ9HCS5 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
EPB41L4AQ9HCS5 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms