Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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