Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCAF1Q9H7N4 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCAF1Q9H7N4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCAF1Q9H7N4 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCAF1Q9H7N4 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCAF1Q9H7N4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SCAF1Q9H7N4 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCAF1Q9H7N4 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SCAF1Q9H7N4 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCAF1Q9H7N4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCAF1Q9H7N4 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 AL139317.3-201ENST00000555969 898 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAF1Q9H7N4 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms