Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
C11orf49Q9H6J7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
C11orf49Q9H6J7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
C11orf49Q9H6J7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
C11orf49Q9H6J7 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
C11orf49Q9H6J7 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
C11orf49Q9H6J7 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
C11orf49Q9H6J7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
C11orf49Q9H6J7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
C11orf49Q9H6J7 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
C11orf49Q9H6J7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C11orf49Q9H6J7 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
C11orf49Q9H6J7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C11orf49Q9H6J7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C11orf49Q9H6J7 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C11orf49Q9H6J7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C11orf49Q9H6J7 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C11orf49Q9H6J7 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C11orf49Q9H6J7 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C11orf49Q9H6J7 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C11orf49Q9H6J7 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C11orf49Q9H6J7 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms