Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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