Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS8

LRRC2, Leucine-rich repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC2Q9BYS8 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC2Q9BYS8 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC2Q9BYS8 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC2Q9BYS8 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC2Q9BYS8 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC2Q9BYS8 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC2Q9BYS8 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC2Q9BYS8 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC2Q9BYS8 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC2Q9BYS8 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC2Q9BYS8 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC2Q9BYS8 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC2Q9BYS8 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC2Q9BYS8 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC2Q9BYS8 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC2Q9BYS8 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC2Q9BYS8 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC2Q9BYS8 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC2Q9BYS8 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC2Q9BYS8 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC2Q9BYS8 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC2Q9BYS8 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC2Q9BYS8 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC2Q9BYS8 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC2Q9BYS8 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC2Q9BYS8 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC2Q9BYS8 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms