Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms