Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC4A5Q9BY07 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms