Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms