Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLVAPQ9BX97 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLVAPQ9BX97 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PLVAPQ9BX97 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PLVAPQ9BX97 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLVAPQ9BX97 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PLVAPQ9BX97 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLVAPQ9BX97 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLVAPQ9BX97 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLVAPQ9BX97 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLVAPQ9BX97 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLVAPQ9BX97 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLVAPQ9BX97 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLVAPQ9BX97 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLVAPQ9BX97 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLVAPQ9BX97 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLVAPQ9BX97 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLVAPQ9BX97 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLVAPQ9BX97 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLVAPQ9BX97 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLVAPQ9BX97 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLVAPQ9BX97 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLVAPQ9BX97 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLVAPQ9BX97 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PLVAPQ9BX97 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLVAPQ9BX97 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLVAPQ9BX97 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PLVAPQ9BX97 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLVAPQ9BX97 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLVAPQ9BX97 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLVAPQ9BX97 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLVAPQ9BX97 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLVAPQ9BX97 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLVAPQ9BX97 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLVAPQ9BX97 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLVAPQ9BX97 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PLVAPQ9BX97 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLVAPQ9BX97 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PLVAPQ9BX97 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLVAPQ9BX97 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLVAPQ9BX97 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLVAPQ9BX97 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLVAPQ9BX97 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLVAPQ9BX97 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLVAPQ9BX97 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLVAPQ9BX97 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLVAPQ9BX97 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLVAPQ9BX97 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLVAPQ9BX97 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLVAPQ9BX97 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLVAPQ9BX97 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLVAPQ9BX97 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLVAPQ9BX97 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLVAPQ9BX97 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLVAPQ9BX97 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
PLVAPQ9BX97 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PLVAPQ9BX97 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PLVAPQ9BX97 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PLVAPQ9BX97 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PLVAPQ9BX97 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PLVAPQ9BX97 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PLVAPQ9BX97 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PLVAPQ9BX97 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PLVAPQ9BX97 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PLVAPQ9BX97 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PLVAPQ9BX97 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PLVAPQ9BX97 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PLVAPQ9BX97 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PLVAPQ9BX97 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PLVAPQ9BX97 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PLVAPQ9BX97 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PLVAPQ9BX97 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PLVAPQ9BX97 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PLVAPQ9BX97 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PLVAPQ9BX97 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PLVAPQ9BX97 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PLVAPQ9BX97 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PLVAPQ9BX97 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PLVAPQ9BX97 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PLVAPQ9BX97 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PLVAPQ9BX97 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PLVAPQ9BX97 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PLVAPQ9BX97 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PLVAPQ9BX97 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PLVAPQ9BX97 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PLVAPQ9BX97 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PLVAPQ9BX97 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PLVAPQ9BX97 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PLVAPQ9BX97 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PLVAPQ9BX97 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PLVAPQ9BX97 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PLVAPQ9BX97 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PLVAPQ9BX97 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PLVAPQ9BX97 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PLVAPQ9BX97 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PLVAPQ9BX97 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PLVAPQ9BX97 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PLVAPQ9BX97 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PLVAPQ9BX97 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PLVAPQ9BX97 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms