Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms