Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms