Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
THUMPD2Q9BTF0 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
THUMPD2Q9BTF0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
THUMPD2Q9BTF0 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
THUMPD2Q9BTF0 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
THUMPD2Q9BTF0 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
THUMPD2Q9BTF0 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
THUMPD2Q9BTF0 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
THUMPD2Q9BTF0 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
THUMPD2Q9BTF0 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
THUMPD2Q9BTF0 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
THUMPD2Q9BTF0 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms