Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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