Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms