Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms