Protein–RNA interactions for Protein: Q99624

SLC38A3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A3Q99624 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC38A3Q99624 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC38A3Q99624 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC38A3Q99624 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC38A3Q99624 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC38A3Q99624 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC38A3Q99624 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC38A3Q99624 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC38A3Q99624 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC38A3Q99624 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC38A3Q99624 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC38A3Q99624 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC38A3Q99624 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC38A3Q99624 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC38A3Q99624 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC38A3Q99624 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms