Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PIK3R4Q99570 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIK3R4Q99570 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIK3R4Q99570 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIK3R4Q99570 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIK3R4Q99570 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIK3R4Q99570 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIK3R4Q99570 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIK3R4Q99570 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIK3R4Q99570 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIK3R4Q99570 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIK3R4Q99570 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIK3R4Q99570 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIK3R4Q99570 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIK3R4Q99570 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIK3R4Q99570 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIK3R4Q99570 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIK3R4Q99570 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIK3R4Q99570 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIK3R4Q99570 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIK3R4Q99570 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIK3R4Q99570 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PIK3R4Q99570 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PIK3R4Q99570 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIK3R4Q99570 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIK3R4Q99570 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIK3R4Q99570 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIK3R4Q99570 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIK3R4Q99570 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIK3R4Q99570 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIK3R4Q99570 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIK3R4Q99570 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIK3R4Q99570 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIK3R4Q99570 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIK3R4Q99570 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIK3R4Q99570 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIK3R4Q99570 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIK3R4Q99570 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIK3R4Q99570 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIK3R4Q99570 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIK3R4Q99570 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIK3R4Q99570 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIK3R4Q99570 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIK3R4Q99570 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIK3R4Q99570 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIK3R4Q99570 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIK3R4Q99570 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIK3R4Q99570 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIK3R4Q99570 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIK3R4Q99570 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIK3R4Q99570 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIK3R4Q99570 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIK3R4Q99570 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIK3R4Q99570 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIK3R4Q99570 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIK3R4Q99570 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIK3R4Q99570 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIK3R4Q99570 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIK3R4Q99570 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIK3R4Q99570 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIK3R4Q99570 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PIK3R4Q99570 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIK3R4Q99570 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIK3R4Q99570 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIK3R4Q99570 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIK3R4Q99570 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIK3R4Q99570 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms