Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD1Q99460 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD1Q99460 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms