Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

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Length 1,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP47Q96K76 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP47Q96K76 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP47Q96K76 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP47Q96K76 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
USP47Q96K76 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP47Q96K76 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP47Q96K76 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
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