Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC11Q96DB2 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HDAC11Q96DB2 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HDAC11Q96DB2 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HDAC11Q96DB2 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms