Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
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FAM3DQ96BQ1 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
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FAM3DQ96BQ1 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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FAM3DQ96BQ1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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FAM3DQ96BQ1 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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FAM3DQ96BQ1 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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FAM3DQ96BQ1 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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FAM3DQ96BQ1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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FAM3DQ96BQ1 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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FAM3DQ96BQ1 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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FAM3DQ96BQ1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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FAM3DQ96BQ1 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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FAM3DQ96BQ1 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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FAM3DQ96BQ1 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM3DQ96BQ1 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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