Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms