Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

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Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
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PTPRUQ92729 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
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PTPRUQ92729 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
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PTPRUQ92729 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
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PTPRUQ92729 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRUQ92729 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
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PTPRUQ92729 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
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PTPRUQ92729 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
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PTPRUQ92729 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRUQ92729 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRUQ92729 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
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PTPRUQ92729 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
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PTPRUQ92729 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
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PTPRUQ92729 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRUQ92729 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRUQ92729 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRUQ92729 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
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PTPRUQ92729 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRUQ92729 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRUQ92729 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRUQ92729 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRUQ92729 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRUQ92729 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRUQ92729 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRUQ92729 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRUQ92729 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRUQ92729 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRUQ92729 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRUQ92729 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRUQ92729 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
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