Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX93

PALLD, Palladin, humanhuman

Predictions only

Length 1,383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALLDQ8WX93 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PALLDQ8WX93 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PALLDQ8WX93 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PALLDQ8WX93 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PALLDQ8WX93 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PALLDQ8WX93 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PALLDQ8WX93 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PALLDQ8WX93 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PALLDQ8WX93 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PALLDQ8WX93 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PALLDQ8WX93 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PALLDQ8WX93 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PALLDQ8WX93 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PALLDQ8WX93 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PALLDQ8WX93 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PALLDQ8WX93 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PALLDQ8WX93 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PALLDQ8WX93 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PALLDQ8WX93 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PALLDQ8WX93 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PALLDQ8WX93 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PALLDQ8WX93 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PALLDQ8WX93 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PALLDQ8WX93 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PALLDQ8WX93 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PALLDQ8WX93 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PALLDQ8WX93 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PALLDQ8WX93 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PALLDQ8WX93 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PALLDQ8WX93 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PALLDQ8WX93 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PALLDQ8WX93 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PALLDQ8WX93 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PALLDQ8WX93 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PALLDQ8WX93 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PALLDQ8WX93 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PALLDQ8WX93 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PALLDQ8WX93 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PALLDQ8WX93 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PALLDQ8WX93 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PALLDQ8WX93 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PALLDQ8WX93 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PALLDQ8WX93 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PALLDQ8WX93 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PALLDQ8WX93 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PALLDQ8WX93 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PALLDQ8WX93 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PALLDQ8WX93 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PALLDQ8WX93 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PALLDQ8WX93 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PALLDQ8WX93 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PALLDQ8WX93 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PALLDQ8WX93 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PALLDQ8WX93 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PALLDQ8WX93 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PALLDQ8WX93 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PALLDQ8WX93 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PALLDQ8WX93 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PALLDQ8WX93 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PALLDQ8WX93 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PALLDQ8WX93 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PALLDQ8WX93 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PALLDQ8WX93 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PALLDQ8WX93 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PALLDQ8WX93 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PALLDQ8WX93 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PALLDQ8WX93 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PALLDQ8WX93 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PALLDQ8WX93 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PALLDQ8WX93 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PALLDQ8WX93 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms