Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms