Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HELBQ8NG08 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms