Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96 ms