Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYCP3Q8IZU3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYCP3Q8IZU3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms