Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms