Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms