Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
YTHDF3Q7Z739 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
YTHDF3Q7Z739 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms