Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE3BQ7Z3V4 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBE3BQ7Z3V4 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
UBE3BQ7Z3V4 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBE3BQ7Z3V4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBE3BQ7Z3V4 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBE3BQ7Z3V4 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBE3BQ7Z3V4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBE3BQ7Z3V4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBE3BQ7Z3V4 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBE3BQ7Z3V4 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBE3BQ7Z3V4 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE3BQ7Z3V4 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE3BQ7Z3V4 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms