Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5L3

GDPD3, Lysophospholipase D GDPD3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD3Q7L5L3 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms