Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q71RC1 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q71RC1 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q71RC1 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q71RC1 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q71RC1 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q71RC1 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q71RC1 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q71RC1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q71RC1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q71RC1 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q71RC1 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q71RC1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q71RC1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q71RC1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q71RC1 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q71RC1 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q71RC1 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q71RC1 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q71RC1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q71RC1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q71RC1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q71RC1 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q71RC1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q71RC1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q71RC1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q71RC1 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q71RC1 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q71RC1 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q71RC1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q71RC1 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q71RC1 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q71RC1 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q71RC1 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q71RC1 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q71RC1 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q71RC1 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q71RC1 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q71RC1 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q71RC1 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q71RC1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q71RC1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q71RC1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q71RC1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q71RC1 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q71RC1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q71RC1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q71RC1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q71RC1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q71RC1 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q71RC1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q71RC1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q71RC1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q71RC1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q71RC1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q71RC1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q71RC1 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q71RC1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q71RC1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q71RC1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q71RC1 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q71RC1 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q71RC1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q71RC1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q71RC1 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q71RC1 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q71RC1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q71RC1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q71RC1 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q71RC1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q71RC1 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q71RC1 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q71RC1 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q71RC1 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q71RC1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q71RC1 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q71RC1 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q71RC1 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q71RC1 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q71RC1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q71RC1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q71RC1 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q71RC1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q71RC1 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q71RC1 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q71RC1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q71RC1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q71RC1 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q71RC1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q71RC1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q71RC1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q71RC1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q71RC1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q71RC1 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q71RC1 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q71RC1 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q71RC1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q71RC1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q71RC1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q71RC1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms