Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms