Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms