Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms