Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EDC4Q6P2E9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EDC4Q6P2E9 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EDC4Q6P2E9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EDC4Q6P2E9 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDC4Q6P2E9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDC4Q6P2E9 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDC4Q6P2E9 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDC4Q6P2E9 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
EDC4Q6P2E9 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
EDC4Q6P2E9 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
EDC4Q6P2E9 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDC4Q6P2E9 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDC4Q6P2E9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDC4Q6P2E9 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDC4Q6P2E9 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDC4Q6P2E9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDC4Q6P2E9 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDC4Q6P2E9 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDC4Q6P2E9 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDC4Q6P2E9 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDC4Q6P2E9 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDC4Q6P2E9 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDC4Q6P2E9 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDC4Q6P2E9 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EDC4Q6P2E9 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EDC4Q6P2E9 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms