Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms