Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms