Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CC2D1BQ5T0F9 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms