Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TDRD12Q587J7 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms